Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCTD13Q8WZ19 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCTD13Q8WZ19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms