Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSRNP3Q8WYN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms