Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCG3Q8WXD2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCG3Q8WXD2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms