Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms