Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms