Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMG8Q8ND04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms