Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP38Q8NB14 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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