Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL3Q8N8U3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RTL3Q8N8U3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms