Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSGALNACT2Q8N6G5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms