Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms