Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTU1Q7Z7A3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTU1Q7Z7A3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms