Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms