Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HRCT1Q6UXD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms