Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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LCN8Q6JVE9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LCN8Q6JVE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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