Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC1Q5VXU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms