Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms