Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COLEC12Q5KU26 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms