Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC2HC1CQ53FD0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms