Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms