Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms