Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms