Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms