Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP1R3AQ16821 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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