Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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