Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SEC31B-211ENST00000492667 2920 ntTSL 210.86□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EMG1-206ENST00000607161 1087 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 PIK3CD-203ENST00000479223 539 ntTSL 310.61□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-209ENST00000481180 1751 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-208ENST00000479653 541 ntTSL 310.27□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 PPIP5K2-216ENST00000613907 1070 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EMG1-205ENST00000261406 958 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.89□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 49.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-221ENST00000530691 6307 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM248-202ENST00000413593 637 ntTSL 49.12□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 HDAC7-225ENST00000491464 548 ntTSL 48.95□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 HEPH-208ENST00000471121 802 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-209ENST00000601935 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 BRD7-207ENST00000569774 416 ntTSL 38.59□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ELOA-202ENST00000487554 501 ntTSL 38.55□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-207ENST00000600313 543 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 58.33□□□□□ -1.082e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 OAT-206ENST00000490096 579 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 PPIP5K2-213ENST00000511724 1063 ntTSL 58.04□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 47.28□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-206ENST00000600299 4227 nt6.84□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-207ENST00000463907 1623 ntTSL 26.48□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EMG1-201ENST00000539196 616 ntTSL 26.47□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM237-211ENST00000489550 558 ntTSL 46.38□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 USP30-208ENST00000536393 476 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 DRAM2-202ENST00000461449 611 ntTSL 36.25□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.482e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 35.65□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 YTHDC1-205ENST00000507529 689 ntTSL 35.54□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-202ENST00000370276 4779 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-206ENST00000463364 1625 ntTSL 1 (best)5.19□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-209ENST00000469622 556 ntTSL 45.15□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-213ENST00000481825 2857 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-215ENST00000489231 622 ntTSL 25.11□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-212ENST00000480723 584 ntTSL 34.72□□□□□ -1.652e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-208ENST00000466061 1564 ntTSL 1 (best)4.5□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SNX5-205ENST00000463050 845 ntTSL 24.48□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-210ENST00000469887 3149 ntTSL 54.38□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM237-207ENST00000466641 720 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EPCAM-206ENST00000490733 752 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-205ENST00000461920 2208 ntTSL 24.15□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 OAT-207ENST00000492376 620 ntTSL 33.98□□□□□ -1.772e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EIF3E-217ENST00000523646 544 ntTSL 23.89□□□□□ -1.792e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SNX5-209ENST00000476648 950 ntTSL 33.75□□□□□ -1.812e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-205ENST00000599535 721 ntTSL 33.54□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 LGR4-205ENST00000527773 420 ntTSL 23.47□□□□□ -1.852e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYP3A5-204ENST00000456417 594 ntTSL 53.45□□□□□ -1.862e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ZNF675-203ENST00000597074 595 ntTSL 33.4□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 OAT-204ENST00000476917 646 ntTSL 32.61□□□□□ -1.992e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 PPIP5K2-210ENST00000509597 2799 ntTSL 22.09□□□□□ -2.082e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.32e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-209ENST00000465913 1573 ntTSL 26.23□□□□□ -1.412e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-212ENST00000492082 2031 ntTSL 55.47□□□□□ -1.532e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.62e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ALDH4A1-203ENST00000432718 844 ntTSL 314.66□□□□□ -0.067e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 NDUFS7-217ENST00000591358 3743 nt12.07□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MUM1-205ENST00000587460 2793 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 37
SF3B4Q15427 RPL13-215ENST00000570149 435 ntTSL 211.06□□□□□ -0.646e-25■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-207ENST00000564655 935 ntTSL 320.79■□□□□ 0.925e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-206ENST00000564115 845 ntTSL 519.92■□□□□ 0.785e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.075e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.115e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-204ENST00000563166 399 ntTSL 511.99□□□□□ -0.495e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 COQ9-216ENST00000569980 1118 ntTSL 26.17□□□□□ -1.425e-11■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-228ENST00000532856 573 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-216ENST00000489458 790 ntTSL 37.41□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-230ENST00000534658 763 ntTSL 56.63□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-217ENST00000490149 873 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-227ENST00000532021 696 ntTSL 34.54□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-212ENST00000475882 615 ntTSL 33.89□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 37
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 1314.4 ms