Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KARSQ15046 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KARSQ15046 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KARSQ15046 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KARSQ15046 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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