Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IHHQ14623 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IHHQ14623 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IHHQ14623 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IHHQ14623 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IHHQ14623 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms