Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1CQ14123 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1CQ14123 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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