Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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