Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN4PQ13434 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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