Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN3Q13286 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLN3Q13286 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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