Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YDR115WYDR115W 318 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 HTD2YHR067W 843 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 FMC1YIL098C 468 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MSL1YIR009W 336 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 PAM16YJL104W 450 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 SVS1YPL163C 783 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MYO2YOR326W 4725 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YDL183CYDL183C 963 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YGR242WYGR242W 309 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 RLP24YLR009W 600 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 HTA2YBL003C 399 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 PEX12YMR026C 1200 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YSP1YHR155W 3687 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 URC2YDR520C 2319 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MED1YPR070W 1701 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 TAZ1YPR140W 1146 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 GAS2YLR343W 1668 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 ULP2YIL031W 3105 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 RLF2YPR018W 1821 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 WBP1YEL002C 1293 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 RPL1BYGL135W 654 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 PML1YLR016C 615 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 RPL1AYPL220W 654 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 GPI17YDR434W 1605 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YKR011CYKR011C 1062 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YPR078CYPR078C 1119 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 COG1YGL223C 1254 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 PRM9YAR031W 897 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 SCC2YDR180W 4482 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 NEM1YHR004C 1341 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 VMR1YHL035C 4779 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 MAK5YBR142W 2322 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 PEX14YGL153W 1026 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 COS12YGL263W 1143 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YIR043CYIR043C 693 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YLR366WYLR366W 306 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 ATX2YOR079C 942 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 AIM14YGL160W 1713 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 PTC5YOR090C 1719 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 FIR1YER032W 2631 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 ATG9YDL149W 2994 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 IRC6YFR043C 714 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 CMR3YPR013C 954 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 SPT7YBR081C 3999 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 IMG2YCR071C 441 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 RRT7YLL030C 342 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YLR416CYLR416C 399 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 MGA1YGR249W 1371 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YPS5YGL259W 498 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 PCL5YHR071W 690 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YIL086CYIL086C 309 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YET1YKL065C 621 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YMR321CYMR321C 318 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 HHF1YBR009C 312 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 YBR174CYBR174C 315 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1B-BLQ12490 MAD3YJL013C 1548 nt1.53□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 ALG8YOR067C 1734 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 RLP7YNL002C 969 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 BIR1YJR089W 2865 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YDR336WYDR336W 945 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 PMI40YER003C 1290 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 UPS2YLR168C 693 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 SKI8YGL213C 1194 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YPT52YKR014C 705 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 BUR2YLR226W 1188 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 UTP25YIL091C 2166 nt1.51□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 RGL1YPL066W 1440 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 TPP1YMR156C 717 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 MRPL44YMR225C 297 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YOL035CYOL035C 303 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 GRE2YOL151W 1029 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 SPT14YPL175W 1359 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 RPA34YJL148W 702 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YLR124WYLR124W 345 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YOL134CYOL134C 390 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 RAD18YCR066W 1464 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 CDC10YCR002C 969 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 PGD1YGL025C 1194 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YJL119CYJL119C 324 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.49□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 GCN2YDR283C 4980 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YIL080WYIL080W 4722 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 PET127YOR017W 2403 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YMR160WYMR160W 2451 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 ARG3YJL088W 1017 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YBR238CYBR238C 2196 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 RPS29BYDL061C 171 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 YGR117CYGR117C 1431 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 PKH2YOL100W 3246 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 SWI4YER111C 3282 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 MNT3YIL014W 1893 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1B-BLQ12490 CDC39YCR093W 6327 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BLQ12490 YNL011CYNL011C 1335 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BLQ12490 YLR076CYLR076C 423 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1B-BLQ12490 EGD1YPL037C 474 nt1.46□□□□□ -2.18
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