Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 SSN8YNL025C 972 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 PTP3YER075C 2787 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SRP68YPL243W 1800 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YKR078WYKR078W 1758 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 NTF2YER009W 378 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 APQ13YJL075C 417 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YJL119CYJL119C 324 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RPL17BYJL177W 555 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SRP21YKL122C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YKR051WYKR051W 1257 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 BET3YKR068C 582 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YLR456WYLR456W 615 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ATG3YNR007C 933 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YOR055WYOR055W 435 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 PFY1YOR122C 381 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MSH2YOL090W 2895 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MMS1YPR164W 4224 nt2.97□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YFR054CYFR054C 579 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PRS3YHL011C 963 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PAI3YMR174C 207 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 ATX1YNL259C 222 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YOR277CYOR277C 309 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 CSM4YPL200W 471 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 JID1YPR061C 906 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 BRE5YNR051C 1548 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SYO1YDL063C 1863 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MUB1YMR100W 1863 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 NOP12YOL041C 1380 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RED1YLR263W 2484 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SLK19YOR195W 2466 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MYO5YMR109W 3660 nt2.96□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 VHR1YIL056W 1923 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 ASI3YNL008C 2031 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SVL3YPL032C 2478 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 UTP15YMR093W 1542 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MET5YJR137C 4329 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 REG1YDR028C 3045 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MPO1YGL010W 525 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MVB12YGR206W 306 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PCL5YHR071W 690 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YNL089CYNL089C 477 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RPL23AYBL087C 414 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MSN1YOL116W 1149 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 ESC1YMR219W 4977 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PEX5YDR244W 1839 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PHO81YGR233C 3537 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YDR239CYDR239C 2364 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SPP382YLR424W 2127 nt2.95□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MLH1YMR167W 2310 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PDC2YDR081C 2778 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YDL016CYDL016C 303 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 FIN1YDR130C 876 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 GIC1YHR061C 945 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YJR141WYJR141W 1044 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 DYN3YMR299C 939 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RBL2YOR265W 321 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MBA1YBR185C 837 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YOL098CYOL098C 3114 nt2.94□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YKL075CYKL075C 1353 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YDR133CYDR133C 336 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 CPR5YDR304C 678 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 NCB2YDR397C 441 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 HYP2YEL034W 474 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RPL11BYGR085C 525 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SDL1YIL167W 633 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RPL8BYLL045C 771 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PDR17YNL264C 1053 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 CSI2YOL007C 1026 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RPL11AYPR102C 525 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YBR209WYBR209W 318 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YCG1YDR325W 3108 nt2.93□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 AVT5YBL089W 1380 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 snR84snR84 550 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YDR115WYDR115W 318 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PRE1YER012W 597 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 RTT105YER104W 627 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SLX9YGR081C 633 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YKL066WYKL066W 444 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SEC66YBR171W 621 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 TRS20YBR254C 528 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SPF1YEL031W 3648 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.92□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 INO80YGL150C 4470 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MPS1YDL028C 2295 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YJL132WYJL132W 2253 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MUS81YDR386W 1899 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 NEL1YHR035W 1893 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SNA4YDL123W 423 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 PEA2YER149C 1263 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 FAR7YFR008W 666 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 ARC18YLR370C 537 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 SAS2YMR127C 1017 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 YBR051WYBR051W 351 nt2.91□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 MNT3YIL014W 1893 nt2.9□□□□□ -1.94
LSP1Q12230 EMI1YDR512C 564 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 TDA2YER071C 381 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 NYV1YLR093C 762 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 APC9YLR102C 798 nt2.9□□□□□ -1.95
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