Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD3Q0VAK6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms