Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms