Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 TDA8YAL064C-A 381 nt2.79□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 VPS20YMR077C 666 nt2.79□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 RPC40YPR110C 1008 nt2.79□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YCL002CYCL002C 792 nt2.79□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 PBS2YJL128C 2007 nt2.79□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 CDC37YDR168W 1521 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 AGE1YDR524C 1449 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 AXL1YPR122W 3627 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 RSM18YER050C 417 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 SNO3YFL060C 669 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YKL115CYKL115C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YLR202CYLR202C 327 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 ATG38YLR211C 681 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 JIP3YLR331C 378 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YML037CYML037C 1023 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 RPL23AYBL087C 414 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 SNO2YNL334C 669 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 YOL134CYOL134C 390 nt2.78□□□□□ -1.96
CUE5Q08412 BNA4YBL098W 1383 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 ASI3YNL008C 2031 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 ERG28YER044C 447 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MBB1YJL199C 327 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MRPL33YMR286W 261 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RPL16BYNL069C 597 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 AFT2YPL202C 1251 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 PFF1YBR074W 2931 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 APC2YLR127C 2562 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SLP1YOR154W 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 NOP12YOL041C 1380 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RIM13YMR154C 2184 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RTT10YPL183C 3042 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 ORC1YML065W 2745 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SRD1YCR018C 666 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 LOC1YFR001W 615 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 PNC1YGL037C 651 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RPL14BYHL001W 417 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RPL27AYHR010W 411 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 CKA1YIL035C 1119 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 TPK3YKL166C 1197 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YAR069CYAR069C 294 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 COQ10YOL008W 624 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RXT2YBR095C 1293 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 BCK1YJL095W 4437 nt2.76□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RLI1YDR091C 1827 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SLU7YDR088C 1149 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 TAD1YGL243W 1203 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MVB12YGR206W 306 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YJR020WYJR020W 333 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YKL069WYKL069W 543 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 COA4YLR218C 453 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SGT1YOR057W 1188 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SPB1YCL054W 2526 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 GCD10YNL062C 1437 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RIF1YBR275C 5751 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 TOR1YJR066W 7413 nt2.75□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 TOP2YNL088W 4287 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MND1YGL183C 660 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 NOP19YGR251W 591 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 CPR7YJR032W 1182 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YLR257WYLR257W 966 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 CWC24YLR323C 780 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 COX14YML129C 213 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YPL150WYPL150W 2706 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 ISW1YBR245C 3390 nt2.74□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RSE1YML049C 4086 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 NSE4YDL105W 1209 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YDR029WYDR029W 315 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 RAV2YDR202C 1056 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 KEI1YDR367W 666 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SLD5YDR489W 885 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MST27YGL051W 705 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 PEX18YHR160C 852 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 BUD19YJL188C 309 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 SDS22YKL193C 1017 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MST28YAR033W 705 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YKE2YLR200W 345 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 snR191snR191 274 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MUD1YBR119W 897 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MAL33YBR297W 1407 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 NAB3YPL190C 2409 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YEL1YBL060W 2064 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 MMS1YPR164W 4224 nt2.73□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 EMC4YGL231C 573 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 COG2YGR120C 789 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YHR213WYHR213W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 BNR1YIL159W 4128 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 IST3YIR005W 447 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 PRP21YJL203W 843 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 YAR062WYAR062W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 IRC21YMR073C 606 nt2.72□□□□□ -1.97
CUE5Q08412 ATG3YNR007C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms