Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YNL010WYNL010W 726 nt5.05□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YER158CYER158C 1722 nt5.05□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 EXO1YOR033C 2109 nt5.05□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 FKH2YNL068C 2589 nt5.05□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 HUL5YGL141W 2733 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YKL100CYKL100C 1764 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 ERG7YHR072W 2196 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 PAU2YEL049W 363 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 MTC3YGL226W 372 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 CWC24YLR323C 780 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 PHO87YCR037C 2772 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 PDI1YCL043C 1569 nt5.04□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YOL153CYOL153C 1746 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 MVB12YGR206W 306 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 BAT1YHR208W 1182 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 URM1YIL008W 300 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YNL179CYNL179C 438 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 snR10snR10 245 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 YOR050CYOR050C 348 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt5.03□□□□□ -1.6
BUD20Q08004 ECM25YJL201W 1800 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 THI7YLR237W 1797 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 OLI1Q0130 231 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YIL102CYIL102C 306 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 RPS4AYJR145C 786 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 MRP8YKL142W 660 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SHH3YMR118C 591 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YLR001CYLR001C 2589 nt5.02□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 NTH2YBR001C 2343 nt5.01□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 RPS8BYER102W 603 nt5.01□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 RPS21BYJL136C 264 nt5.01□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 snR35snR35 204 nt5.01□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SNX41YDR425W 1878 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 ARG2YJL071W 1725 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 MSH1YHR120W 2880 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 TRX3YCR083W 384 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YPL080CYPL080C 327 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YJR030CYJR030C 2238 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 AAP1YHR047C 2571 nt5□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 KIN82YCR091W 2163 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 MPS3YJL019W 2049 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SGO1YOR073W 1773 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YHR217CYHR217C 462 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YAL065CYAL065C 387 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SAP30YMR263W 606 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 snR32snR32 188 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 ADE3YGR204W 2841 nt4.99□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SKG3YLR187W 3081 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 RIM20YOR275C 1986 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 HTA1YDR225W 399 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 FMP10YER182W 735 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 RPA12YJR063W 378 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 ATP22YDR350C 2055 nt4.98□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 MCH4YOL119C 1506 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 LRE1YCL051W 1752 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 TFB5YDR079C-A 219 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YHR212CYHR212C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 INA22YIR024C 651 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YAR060CYAR060C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 CSR1YLR380W 1227 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SWD3YBR175W 948 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 CUL3YGR003W 2235 nt4.97□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 SKM1YOL113W 1968 nt4.96□□□□□ -1.61
BUD20Q08004 YEL1YBL060W 2064 nt4.96□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 SMI1YGR229C 1518 nt4.96□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 ECM32YER176W 3366 nt4.96□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RNA14YMR061W 2034 nt4.96□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YDR061WYDR061W 1620 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YDR442WYDR442W 393 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YLR053CYLR053C 327 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 HTB2YBL002W 396 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 TOM5YPR133W-A 153 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 BUD5YCR038C 1929 nt4.95□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 ARN2YHL047C 1863 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 ROT2YBR229C 2865 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 DAD4YDR320C-A 219 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RIP1YEL024W 648 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 VAM7YGL212W 951 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 PFY1YOR122C 381 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 EIS1YMR031C 2532 nt4.94□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YLL007CYLL007C 1998 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 BCH2YKR027W 2298 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 SED4YCR067C 3198 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 MZM1YDR493W 372 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 CDC26YFR036W 375 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 COX18YGR062C 951 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YAE1YJR067C 426 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YKL111CYKL111C 336 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 LTP1YPR073C 486 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 HIS4YCL030C 2400 nt4.93□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 LAS21YJL062W 2493 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 MSC2YDR205W 2175 nt4.92□□□□□ -1.62
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