Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	CIN1	YOR349W	3045 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	GLC7	YER133W	939 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	ECO1	YFR027W	846 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YGR242W	YGR242W	309 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YHR138C	YHR138C	345 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	DFG10	YIL049W	762 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	TPM2	YIL138C	486 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	BET3	YKR068C	582 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YLR101C	YLR101C	396 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	SHH3	YMR118C	591 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	TIR2	YOR010C	756 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	IRC16	YPR038W	360 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.43	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RUD3	YOR216C	1455 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RTR1	YER139C	681 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	ERV1	YGR029W	570 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RTS3	YGR161C	792 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	BIG1	YHR101C	1008 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RSM19	YNR037C	276 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	snR54	snR54	86 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	RED1	YLR263W	2484 nt		3.42	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PAU10	YDR542W	363 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YER135C	YER135C	393 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PAU11	YGL261C	363 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PET54	YGR222W	882 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	ILV5	YLR355C	1188 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PAU4	YLR461W	363 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YOL159C	YOL159C	516 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	SPE1	YKL184W	1401 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	PPN1	YDR452W	2025 nt		3.41	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.4	□□□□□ -1.86
PPN1	Q04119	YCR064C	YCR064C	411 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	FAP7	YDL166C	594 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	NSA2	YER126C	786 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	LSM1	YJL124C	519 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	ALG14	YBR070C	714 nt		3.4	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	OTU2	YHL013C	924 nt		3.39	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YAR047C	YAR047C	321 nt		3.39	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.39	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YOR248W	YOR248W	303 nt		3.39	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.39	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	SSF2	YDR312W	1362 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	HOP1	YIL072W	1818 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	MSH4	YFL003C	2637 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RPB9	YGL070C	369 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YJL169W	YJL169W	369 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	SRL3	YKR091W	741 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	PKR1	YMR123W	369 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.38	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	STT4	YLR305C	5703 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	HAA1	YPR008W	2085 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	SSP1	YHR184W	1716 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	ATG31	YDR022C	591 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YAL037W	YAL037W	804 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	YNL179C	YNL179C	438 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	RRD2	YPL152W	1077 nt		3.37	□□□□□ -1.87
PPN1	Q04119	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.37	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms