Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms