Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN7AQ01118 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN7AQ01118 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms