Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IP78347 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms