Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms