Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms