Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAPAP54920 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAPAP54920 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAPAP54920 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAPAP54920 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAPAP54920 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAPAP54920 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAPAP54920 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAPAP54920 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAPAP54920 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAPAP54920 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAPAP54920 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms