Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAD23BP54727 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms