Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 RIM11YMR139W 1113 nt3.41□□□□□ -1.86
SNF12P53628 YOL114CYOL114C 609 nt3.41□□□□□ -1.86
SNF12P53628 URA2YJL130C 6645 nt3.41□□□□□ -1.86
SNF12P53628 SSL1YLR005W 1386 nt3.4□□□□□ -1.86
SNF12P53628 PCK1YKR097W 1650 nt3.4□□□□□ -1.86
SNF12P53628 YDR431WYDR431W 312 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPL1BYGL135W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ERV1YGR029W 570 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPS23AYGR118W 438 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 PET54YGR222W 882 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SMC3YJL074C 3693 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YAR070CYAR070C 300 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 CMC2YBL059C-A 330 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SQS1YNL224C 2304 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPL1AYPL220W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPS23BYPR132W 438 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YPR197CYPR197C 564 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SIZ1YDR409W 2715 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ARG5,6YER069W 2592 nt3.4□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MUB1YMR100W 1863 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 AHC2YCR082W 387 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 GRX2YDR513W 432 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPS8BYER102W 603 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ECO1YFR027W 846 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 CWC24YLR323C 780 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ILV5YLR355C 1188 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 FLD1YLR404W 858 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SHH3YMR118C 591 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RPS7AYOR096W 573 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YSY6YBR162W-A 198 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SRP68YPL243W 1800 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 HBT1YDL223C 3141 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YEL1YBL060W 2064 nt3.39□□□□□ -1.87
SNF12P53628 VIP1YLR410W 3441 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YDL009CYDL009C 324 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ARF1YDL192W 546 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 STE14YDR410C 720 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SMT3YDR510W 306 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SMX2YFL017W-A 234 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YFR054CYFR054C 579 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 DFG10YIL049W 762 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RNH203YLR154C 333 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 TVP18YMR071C 504 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MRPL40YPL173W 894 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 LTP1YPR073C 486 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YNL193WYNL193W 1677 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SSF2YDR312W 1362 nt3.38□□□□□ -1.87
SNF12P53628 VBA4YDR119W 2307 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YAL037WYAL037W 804 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 PKR1YMR123W 369 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YPL185WYPL185W 396 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YPR053CYPR053C 456 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MSD1YPL104W 1977 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RRN6YBL014C 2685 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RDS1YCR106W 2499 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 JEN1YKL217W 1851 nt3.37□□□□□ -1.87
SNF12P53628 DBF20YPR111W 1695 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SNT1YCR033W 3681 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 PEX5YDR244W 1839 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YDL242WYDL242W 354 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 VFA1YER128W 612 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 SPC1YJR010C-A 285 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 HIT1YJR055W 495 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 ARV1YLR242C 966 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 COX8YLR395C 237 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YOR199WYOR199W 330 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 PIS1YPR113W 663 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 TCB3YML072C 4638 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MPS1YDL028C 2295 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MAK5YBR142W 2322 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.36□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YDR061WYDR061W 1620 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 FAP7YDL166C 594 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 GPI19YDR437W 423 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 PAU13YHL046C 363 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 IRC16YPR038W 360 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 CWH41YGL027C 2502 nt3.35□□□□□ -1.87
SNF12P53628 REG1YDR028C 3045 nt3.34□□□□□ -1.87
SNF12P53628 CDC26YFR036W 375 nt3.34□□□□□ -1.87
SNF12P53628 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.34□□□□□ -1.87
SNF12P53628 RMP1YLR145W 606 nt3.34□□□□□ -1.87
SNF12P53628 MYO5YMR109W 3660 nt3.34□□□□□ -1.88
SNF12P53628 CIN1YOR349W 3045 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 LCB4YOR171C 1875 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 MSH2YOL090W 2895 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 YGR053CYGR053C 852 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 BET3YKR068C 582 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 GTT2YLL060C 702 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 YLR269CYLR269C 351 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 RPS8AYBL072C 603 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 YOL134CYOL134C 390 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.33□□□□□ -1.88
SNF12P53628 RED1YLR263W 2484 nt3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms