Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDST1P52848 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST1P52848 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST1P52848 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST1P52848 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST1P52848 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST1P52848 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms