Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSC2P49815 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSC2P49815 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSC2P49815 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSC2P49815 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC2P49815 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC2P49815 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC2P49815 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSC2P49815 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms