Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP153P49790 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUP153P49790 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUP153P49790 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUP153P49790 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NUP153P49790 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms