Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSEN1P49768 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms